1，基質(zhì)前處理較液體發(fā)酵少，例如簡單加水使基質(zhì)潮濕，或簡單磨破基質(zhì)增加接觸面積即可，不需特殊機具，一般家庭即可進行步驟。 　　

2，因獲得水分可減少雜菌污染，此種低滅菌步驟即可施行的發(fā)酵，適合低技術地區(qū)使用。 　　
3，能產(chǎn)生特殊產(chǎn)物，如紅麴產(chǎn)生的紅色色素是液體發(fā)酵的十倍，又Aspergillus在固體發(fā)酵所產(chǎn)生的glucosidase較液體發(fā)酵產(chǎn)生的酵素更具耐熱性。 　　
4,下游的回收純化過程及廢棄物處理通常較簡化或單純，常是整個基質(zhì)都被使用，如做為飼料添加物則不需要回收及純化，無廢棄物的問題。 　　
5， 固體發(fā)酵可食品產(chǎn)生特殊風味，并提高營養(yǎng)價值，如天培可作為肉類的代用品，其胺基酸及脂肪酸易被人體消化吸收。

6，培養(yǎng)基單純，例如谷物類、小麥麩、小麥草、大宗谷物或農(nóng)產(chǎn)品等均可被使用，發(fā)酵原料成本較經(jīng)濟。 　

7，固體發(fā)酵相當于使用相當高的培養(yǎng)基，且能用較小的反應器進行發(fā)酵，單位體積的產(chǎn)量較液體為高。